Além da Editora Fiocruz, que concentra a maior parte dos lançamentos da Fundação, outras unidades também publicam obras de caráter científico. Muitos desses títulos estão disponíveis para acesso aberto, em consonância com a política de democratização do conhecimento.
A Escola de Saúde Politécnica Joaquim Venâncio (ESPJV) incentiva publicações de professores, pesquisadores, alunos e parceiros, em linhas de pesquisa que priorizam o projeto pedagógico da escola. Hoje, conta com mais de 40 títulos, muitos contemplados pela política de acesso livre e gratuito, com versões em pdf disponibilizadas na internet. Confira os títulos da ESPJV.
Históricos e estudos de caso de doenças infecciosas e parasitárias estão entre os temas das publicações do Instituto Oswaldo Cruz (IOC). Todas elas estão disponíveis on-line.