O exame anátomo-patológico é indicado para diagnóstico de doenças infecciosas em seres humanos e para vigilância de doenças em primatas humanos e não humanos, como por exemplo da febre amarela e da malária. Ao final do serviço o médico requisitante terá o laudo do exame (através de registro no sistema informatizado GAL) e os gestores do SUS das áreas de vigilância, nas três esferas, terão acesso aos resultados de interesse para vigilância em saúde (também através do GAL).