O Laboratório de Flavivírus (LABFLA) atua como Laboratório de Referência Regional para chikungunya, realizando diversas analises sorologicas e moleculares para identificação de amostras de chikungunya ;As informações geradas no LABFLA auxiliam os órgãos de vigilância nacionais no monitoramento de epidemias, introdução de vírus exóticos e esclarecimento em diagnósticos imprecisos. O LABFLA ainda desenvolve projetos de pesquisa, e formação de recursos humanos em diferentes temas relacionados a epidemiologia e diagnóstico de chikungunya.