A Biblioteca de História das Ciências e da Saúde recebe visitantes no local e também pode ser acessada pela internet. Possui mais de 80 mil itens, incluindo livros, teses, dissertações, revistas e folhetos, além de coleções especiais de importantes nomes e instituições da saúde brasileira, como Oswaldo Cruz e Carlos Chagas, entre outros. O serviço de consulta ao acervo é gratuito para o cidadão, havendo cobrança somente em caso de solicitação de cópia ou imagem digital dos itens.