Las bibliotecas de la Fiocruz están articuladas en una red de cooperación, que tiene por objetivo cualificar el atendimiento al usuario y potencializar sus acciones para la difusión de la información científica y tecnológica en salud. Los acervos bibliográficos están disponibles en diversas unidades de la Fundación.
Integran el grupo de las bibliotecas físicas:
Biblioteca de Ciencias Biomédicas
Biblioteca de Salud Pública
Biblioteca de Salud de la Mujer y de los Niños
Biblioteca de la Escuela Politécnica de Salud Joaquim Venâncio (EPSJV) - Emília Bustamante
Biblioteca de História de las Ciencias y de la Salud / Casa de Oswaldo Cruz (COC)
Biblioteca de Educación y Divulgación Científica / Museo de la Vida
Biblioteca del Instituto Nacional de Control de Calidad en Salud (INCQS)
Biblioteca del Centro de Estudios de la Salud del Trabajador y Ecología Humana (Cesteh/Ensp)
Biblioteca de Farmanguinhos
Biblioteca Fiocruz Brasília
Biblioteca Interinstitucional Eurydice Pires de Sant'Anna (Fiocruz Bahia)
Biblioteca del Centro de Pesquisas René Rachou (Fiocruz Minas)
Biblioteca del Centro de Pesquisas Aggeu Magalhães (Fiocruz Pernambuco)
Biblioteca del Centro de Pesquisas Leônidas & Maria Deane (Fiocruz Amazônia)