Más de mil proyectos de investigación y desarrollo tecnológico son ejecutados en la Fundación Oswaldo Cruz. Ellos producen conocimientos para el control de enfermedades como sida, malária, Chagas, tuberculosis, hanseniasis, rubéola, esquistosomosis, meningitis y hepatitis y sobre otros temas relacionados a la salud colectiva, tales como violencia, cambios climáticos y historia de la ciencia.
Fiocruz es la principal institución no universitaria de formación y calificación de recursos humanos para el Sistema Único de Salud (SUS – el sistema de salud brasileño) y para el área de ciencia y tecnología en Brasil. La institución ofrece 18 programas de posgrado stricto sensu en áreas diversificadas y otros tantos programas lato sensu, además de poseer una escuela de nivel técnico.