La Fiocruz inauguró en 2011 una oficina regional en la capital Campo Grande (MS). La unidad forma parte de la política de expansión y regionalización de las actividades de ciencia y tecnología para el fortalecimiento de la capacidad de intervención del Estado, aliada a políticas de reducción de las desigualdades regionales.
Los profesionales de la Fiocruz Mato Grosso do Sul actúan en cuatro áreas temáticas prioritarias: Medio ambiente y salud – biodiversidad y agronegocio; Salud de las poblaciones indígenas; Salud y sociedad; Salud en las fronteras.