Fundado en marzo de 2008, el Instituto Carlos Chagas (ICC) tuvo su origen en 1999 con la creación del Instituto de Biología Molecular de Paraná (IBMP), resultado de una aparcería de la Fiocruz con el gobierno de aquel estado. Localizado en el campus del Instituto de Tecnología de Paraná (Tecpar), en la ciudad industrial de Curitiba, el ICC ocupa un área de 2.800 metros cuadrados.