Además de la generación de conocimiento, Fiocruz actúa para el desarrollo de productos y procesos con aplicación potencial, como nuevas vacunas, medicinas con base en plantas, métodos diagnósticos, monitoria de la salud del trabajador, ampliación del número de patentes brasileñas y mejoría del sistema de salud nacional.
Estas actividades están entre las más relevantes en el contexto actual de políticas públicas de ciencia y tecnología dirigidas a la innovación del complejo productivo de la salud.