O serviço de referência em Leishmanioses oferece atendimento clínico para pacientes. Realiza diagnóstico diferencial utilizando as ferramentas parasitológicas, imunilógicas e moleculares, bem como o desenvolvimento de novas ferramentas laboratoriais e epidemiológicas para a investigação do agravo. Realiza controle de qualidade de lâminas para os LACENS do nordeste e Bogotá (OMS). Também realiza capacitações para as secretarias municipais e estaduais.