A Coleção de Leptospira, CLEP, está alocada no Centro Colaborador da Organização Mundial da Saúde/Laboratório de Referência Nacional para Leptospirose e dentre suas atividades destacam-se a preservação, o armazenamento, o fornecimento, a caracterização taxonômica e a identificação de Leptospira spp., contribuindo assim para o desenvolvimento científico e tecnológico do Brasil e de outros países.

Poucos laboratórios no mundo possuem coleção semelhante, em virtude dos custos e das dificuldades de manutenção de bactérias do gênero Leptospira, devido ao seu crescimento fastidioso in vitro.

As cepas de referência presentes no acervo da CLEP pertencem à Organização Mundial da Saúde (OMS) e são réplicas de acervos de outras coleções internacionais, compreendendo inúmeros sorovares já identificados para este gênero bacteriano. Há também cepas que foram isoladas pelo próprio laboratório ou recebidas de outros laboratórios do país e do exterior para identificação e que passam a constituir o acervo da CLEP. Desta forma, estes espécimes representam sorovares circulantes em território brasileiro e em outros países , principalmente da América Latina. Estas cepas de origem clínica (humana e animal) são mantidas não só pela sua importância na constituição do acervo, mas também com a finalidade de realização de estudos voltados à epidemiologia e ao desenvolvimento de novos métodos de diagnóstico e de vacinas.

De forma geral, a CLEP, além de um acervo biológico, é um ambiente de ensino e pesquisa, com o compromisso de apoiar o país em todas as situações que envolvam questões relacionadas à leptospirose, bem como, investir no aprimoramento de outros centros de pesquisa e na multiplicação do conhecimento sobre a leptospirose.

No ano de 2011 a Coleção de Coleção de Leptospira, CLEP, foi reconhecida institucionalmente pela Fiocruz, e em 2012 filiou-se à World Federation for Culture Collections, WFCC, sob o registro WDCM 1012.