A área de Patentes da Coordenação de Gestão Tecnológica da Fiocruz (Gestec) é a responsável pela assessoria aos profissionais da instituição, a fim de que os resultados das suas pesquisas sejam protegidos pela legislação de Patentes, tanto no Brasil quanto no exterior. O portfólio de patentes reflete a estratégia da instituição em buscar otimizar a capacidade interna de inovação através da proteção legal em mercados competitivos. Na Fiocruz, a proteção através de patentes visa à transferência de tecnologia com a finalidade de desenvolver parcerias estratégicas capazes de gerar produtos ou serviços na área da saúde e proporcionar apoio estratégico ao Sistema Único de Saúde (SUS), contribuindo para o fortalecimento do Sistema Nacional de Inovação em saúde.
A estratégia para o depósito de patentes na Fiocruz baseia-se nas decisões advindas da Comissão de Propriedade Intelectual da Fiocruz (Copat). O pesquisador da Fundação que tenha algum resultado novo deve procurar o Núcleo de Inovação Tecnológica (NIT) de sua unidade, que vai oferecer todas as informações acerca dos próximos passos no processo de proteção do conhecimento.